Fotonik Bölümü Misyonu, organik ve/veya inorganik yapıların kullanılacağı, ışık dönüştürücü aygıtlar, ışık yayan malzeme ve aygıtlar, yeni nesil güneş hücreleri, sürdürülebilir enerji uygulamaları, alan etkili transistörler, sensörler ve bio-elektronik, baskı hafıza ve devreleri uygulama alanlarında teorik ve uygulamalı lisansüstü eğitim-öğretim ve araştırma faaliyetlerini yürütmek, ilgili ulusal ve uluslararası sanayinin araştırma ve geliştirme faaliyetlerine destek olmak ve yetişmiş eleman ihtiyacını karşılamaktır. Bölüm mezunlarının genel özellikleri analitik düşünebilen, çok disiplinli konu ve projelerde çalışabilen, alanındaki gelişmeleri yakından izleyebilen, her türlü sorumluluk alabilen, bireysel becerileri yanında takım içinde de çalışabilen, iletişim becerileri güçlü profesyoneller şeklinde tanımlanabilir.
Bu genel özelliklerin yanı sıra, lisansüstü tez konuları kapsamında özelleştikleri uygulama alanları için, sorun tespiti ve yeni çözüm/fikir üretebilme yeteneklerine de sahip olurlar.
Fotonik Bölümü Vizyonu, fotonik alanında disiplinler arası yaklaşımla teorik ve deneysel araştırma ve geliştirme çalışmaları yaparak yeni teknolojiler geliştiren, sanayi ile iş birliği içinde çeşitli ürünlerin üretilmesine katkı sağlayan uluslararası öncü bir bölüm olmaktır.